對于出口木托盤，為保護自身木材資源，部分進口木托盤實行強制檢疫制度。木托盤熏蒸的做法是為了避免病蟲害，危害進口國的森林資源。因此，出口貨物中含有木質托盤的貨物在裝運前須停止，熏蒸是其中一種方式。

　　木質托盤熏蒸有兩種方法：藥物熏蒸和熱處理。使用的藥物是甲基溴和環氧乙烷。以下是常用的藥物熏蒸方法。將需要熏蒸的木托盤堆放成一堆，用篷布蓋住，四周壓實，密封，但留一角作為加藥口。
　　在篷布下，在木托盤旁放一盆水，將藥品放入水中;按預留加藥口，使木托盤24小時處于完全密封狀態;翻轉篷布，確保毒氣耗盡后，木托盤需要在完全密封狀態下熏蒸24小時，搬動貨物，約18-24小時;出具熏蒸證明。
　　根據國家質量監督檢驗檢疫總局的規定，木質包裝須是經過加工的木材，且不能含有樹皮等。當木制托盤出口到加拿大、美國、澳大利亞等國家或顧客要求熏蒸時，應強制要求熏蒸。從美國和加拿大出口的木托盤，須提供商檢出具的木質托盤熏蒸證明。